明朝官制ๆ，兵部国防部ຖ尚书部长一人，左ุ右侍郎副部长各一人，下面分设四个司：武选武官人事、职方แ军政、军令、车驾警备、通讯、马匹、武库后勤、训练。职方แ司等于现代的总参谋部，职方司有郎中一人、员外郎一人、主ว事二人。主ว事大概相当于总参谋部中ณ的文职中校副处长。
天启二年，他到เ北京来报告职务。他平日是很喜欢高谈阔论的，大概在北京和友人谈话时，表了一些对辽东军事的见解，很是中ณ肯，引起了御史侯恂才子侯方域的父亲的注意，便向朝廷保荐他有军事才能，于是获升为兵部职方แ司主事自正七品的知县升为正六品的主事。不做地方官了，被派到中央政府的国防部去办事。
神宗见边关上追饷越迫越急，知道挨不下去了，可是始终不肯掏自己腰包，结果想出了一个对策：再加田赋百分之二。连同以前两次，已๐共加百分之九，然而向百姓多征的田赋，未必就拿来军饷，皇帝的基本兴趣是将银子藏之于内库。
万历四十六年七月，熊廷弼刚出山海关，铁ກ岭已经失陷，沈阳及附近诸城堡的军民纷纷逃窜。熊廷弼兼程进入辽阳。经过神宗数十年来的百事不理，军队纪律荡然，士无斗志，骑兵故意将马匹弄死，以避免出战，只要听到敌军来攻，满营兵卒就一哄而散。熊廷弼面临ภ的局面实在困难已极2๐。军饷本已十分微薄，但皇帝还是拚命拖欠，不肯饷3。
他的性格像是一柄锋锐绝伦、精刚无俦的宝剑。当清和升平的时日，悬在壁上，不免会中夜自啸，跃出剑匣。在天昏地暗的乱世，则屠龙杀虎之ใ后，终于寸寸断折。
袁崇焕却是真正的英雄，大才豪气，笼盖当世，即使他的缺点，也是英雄式的惊世骇俗。他比小说中虚构的英雄人物，有更多的英雄气概。
朝廷群臣都知道满桂打仗的本事，但将帅不和总是不对，便依从了。可是经略王之臣极力认为ฦ满桂决不可去。朝廷召还满桂的命令已颁下了，于是听了王之ใ臣的主张，再命满桂镇守山海ร关。袁崇焕坚决不接受。朝廷无法，只得将满桂调回北京，保留左ุ都督原官，派在国防机构办事。
这件事情显然是袁崇焕的蛮子脾气作，冲动起来，作出了违反理智的决定。由á于王之臣袒护满桂，袁崇焕又去和王之ใ臣吵闹。朝廷怕王之ใ臣与袁崇焕不断冲突，坏了大事，于是将指挥权划ฐ分为二：关内的部ຖ队由á辽东经略王之臣指挥，关外部队则由辽东巡抚袁崇焕指挥。经略的官比巡抚大，但这时袁崇焕已不属辽东经略๓管了。
袁崇焕毕竟是个光明磊落的大丈夫，冷静下来之后，知道是自己的不对，于是上奏请再用满桂。朝廷当然批准，派满桂兼统关内外兵马，赐尚方剑。王之臣和袁崇焕是文官，等于现在的政委；满桂是武将，是部队司令。武将受文官指挥。幸亏袁崇焕不坚持错误，否则二次宁远大战，就不能得到เ满桂这样的大将来主持城防。
在这时候，袁崇焕上了一道奏章，提出守辽的基本战略，这道奏章有很大的重要性。其中主张：一、用辽人守辽土；二、屯田à，以辽土养军队；三、以守为主，等待机会再出击。他最担心的事，是立了功劳之ใ后，敌人必定要使反间计，散播谣言，而本国必定有人妒忌毁谤3。
他深知明军的战斗ç力不如清军，野战不利，只有用己之长，所以提出了战术的基本原则ท：“兵不利野战，只有凭坚城、用大炮一策。”
所统带的部队无力打野战，作为主ว帅，自然深感棘手。但训练一支善打野战的劲旅，非一朝一夕之功，那ว是无可奈何的；而对于势所必至的朝臣忌功中伤，更是无可奈何，只有盼望皇帝ຓ和大臣们能加以照顾了。
袁崇焕也不是一味的蛮干，有时也有他机灵的一面。他对魏忠贤派去监视他的两名特务太监敷衍得很好。当年冬天，他带同赵率教以及两名特务太监刘应坤、纪用，兴办防御工事及屯田，渐渐又再收复了高第所放弃的土地。
他在奏章中将这两ä名太监的功劳吹嘘了一番，所以魏忠贤和刘ถ应坤、纪用三人都得到เ了封赏。刘、纪二人似乎也不是坏太监，并没有对袁崇焕掣肘阻挠，后来宁锦大战，刘应坤在宁远上城督战，纪用在锦州上城督战，都勇敢得很。大概ฐ二人为袁崇焕的忠勇所感召，也变得忠勇起来。可见也不是所有的太监都是坏人，主要还在领导者如何领导。
1้《明史·满桂传》：“桂椎鲁甚，然忠勇绝伦，不好声色，与士卒同甘苦。”《明史·赵率教传》：“率教为将廉勇，待士有恩，勤身奉公，劳而不懈，与满桂并称良将。二人既殁，益无能ม办东事者。”
2袁崇焕奏章中说满桂“意气骄矜，谩骂僚属，恐坏封疆大计，乞移之别镇，以关外事权归率教。”
3《明史·袁崇焕传》引述他的奏章：“陛下以关内外分责二臣。用辽人守辽土，且守且战，且筑且屯。屯种所入，可渐减海运。大要坚壁清野以为体，乘间击瑕以为ฦ用。战虽不足，守则ท有余。守既ຂ有余，战无不足。顾勇猛图敌，敌必仇，奋迅立功，众必忌。任劳则ท必召怨，蒙罪始可有功。怨不深则ท劳不著，罪不大则功不成。谤书盈箧，毁言日至，自古已๐然，惟圣明与廷臣始终之。”